子宫内膜异位症特殊的表现与出现的部位有关，通常而言这些特殊表现一般就是盆腔以外的部位出现跟随月经来潮的一些周期性的变化，比如局部的疼痛、出血、包块等等。例如异位病灶位于肠道，则可能出现周期性的少许便血、腹痛、腹泻、便秘等等各种情况。如果是手术部位的病灶，则可能出现周期性的疤痕处疼痛，甚至在疤痕部位深部有触痛性的包块，常见的即剖腹产的手术疤痕疼痛，在月经来潮时出现。有时位于肺部的疾病，也是可能出现周期性的咯血，一般也是跟月经周期有关系。但是当病灶侵犯到输卵管，有的时候可能会出现腰痛、血尿，甚至肾盂积水，继发性的肾脏萎缩等等各种情况。