肚脐在中医讲是一个穴位，叫做神阙穴，位于十四经脉的任脉上。用艾草熏肚脐，即把温热加上艾草的功效作用于神阙穴。

一般认为可以治疗寒性腹痛、腹泻、痢疾、脱肛等。传统的药性理论认为艾草有理气血、逐寒湿、温经、止血、安胎的作用，现代试验研究证明艾草的作用很多，具有抗菌以及抗病毒的作用，可以平喘、止咳、祛痰，也可以止血、抗凝血，还可以镇静、抗过敏，并且能够护肝、利胆等。

在古书同仁中记载，神阙治泻痢不止，小儿利不决，腹大绕脐痛，水肿，鼓胀，肠鸣，状如流水声，久冷伤惫即说明神阙穴在泻痢这方面的作用，对于女性患者而言，用艾草熏肚脐还可以改善宫寒的症状，调节痛经，总之好处多多。