针灸也有禁忌症，如精神高度紧张，患者处于僵直状态，则不适宜针灸。过饥、过饱或情绪过于激动时，不进行针灸。禁忌症有出血倾向的患者，不建议做针灸，因为针灸时或多或少都会碰伤血管引起出血。存在出血倾向的人，凝血机能有障碍，凝血时间会较长，不建议艾灸。

针灸禁忌症还包括小儿未闭合囟门、孕妇腰骶部，以及有感染的部位。糖尿病患者的创口，都是针灸的禁忌部位。对于怀孕的患者，腰骶部以及特殊的穴位，如合谷、三阴交，包括至阴、昆仑都不适宜针灸。