乳铁蛋白通常用于治疗缺铁性贫血。由于缺铁性贫血铁缺乏，会导致血细胞的原料减少，进而导致贫血，而乳铁蛋白富含铁成分，可以用于纠正缺铁性贫血。乳铁蛋白在正常的剂量范围下使用，没有明显的副作用，但过量使用会有副作用，最重要的副作用为铁元素的堆积。
在医学中有一种疾病叫血色病，是由于身体铁的代谢出现了问题，这种疾病会出现面色非常黑暗的症状。铁沉积还会导致胰腺功能障碍，从而出现血糖升高的现象，还会出现明显的肝功能损害。铁金属过量，也会沉积到身体中的脏器，导致相应的功能障碍。因此，乳铁蛋白过量食用，铁在身体中大量的堆积，同样会导致副作用。
