尿道结石的治疗包括对于肾绞痛的治疗、保守治疗、手术治疗。手术治疗包括传统的开放手术，还有微创治疗，具体治疗方式方法，要根据结石的大小、数量、部位、有无并发症决定。6mm以下的结石，主张保守治疗，即用排石的方法进行治疗。肾结石在2cm以下，建议做体外冲击波碎石，2cm以上的结石，主张微创经皮肾镜取石。如果在肾下盏的结石，在1.5cm以下，主张做经皮肾或者输尿管镜进行治疗。输尿管结石分为上段和下段结石。上段输尿管结石在1cm以下包括1cm，主张体外冲击波碎石。如果在1cm以上，建议做输尿管镜或者经皮肾镜取石。如果输尿管下段的结石，建议做输尿管镜取石。膀胱结石的治疗主要是取出结石，去除病因，可以通过开刀取石，腔镜、微创碎石，还有体外碎石。尿道结石的治疗和膀胱结石治疗基本相似，只是不主张做体外冲击波碎石，主要的治疗方式还是腔内的微创取石。
