尿痛的原因最常见的就是尿路感染，多为非特异性的细菌引起感染。可能吃广谱的抗生素，口服三天，症状就缓解，或者是完全痊愈了。但是也考虑其他的特殊细菌的感染，淋球菌，支原体、衣原体甚至结核杆菌的感染。如果反复的尿道疼痛不能痊愈，或者使用了的抗生素治疗不能缓解，一定要找专科医生进行相应的检查，必要的时候做细菌培养，防止耐药细菌的存在。复杂性的因素如合并有结石，膀胱结石或尿道结石的存在，如果伴有尿痛，单纯用抗生素不能缓解，要根据具体情况做相应的特殊的处理，如果有尿道结石要把结石处理才能治疗根本，结石不处理尿道痛的感觉无法消失，合并有感染不处理结石感染也是很难痊愈。所以如果合并有特殊情况的尿路感染，建议患者要处理特殊的原因，复杂性引起尿道痛的原因，同时控制感染才能达到治疗的效果。
