重症感染的并发症有很多，分为局部的，也可以分为全身性的。局部的感染，比如糖尿病的病人，糖尿病足合并感染，可能肢体活动不好，水肿、红肿、疼痛。如果要是全身性的，往往是由于局部的细菌随着血流播散到了全身，引起全身各个器官功能的障碍，也可以引起全身的中毒症状，最后出现衰竭。比如感染性的休克，比如颅内感染、呼吸衰竭、肾功能衰竭、骨髓抑制等等，都是重症感染的并发症。由于感染是所有内科疾病里面，发病机制最复杂的。到目前为止，发病机制仍然还没有能够很好的被医学界里面去解读，重症感染由于涉及到了各个脏器的功能，涉及到全身系统的功能障碍，所以在治疗的过程中非常困难。有的时候需要用通俗的话来讲，需要去拆东墙、补西墙。但是治疗的过程中，除了可能会牺牲某一个脏器去保另外脏器，但是仍然还是要兼顾很多，首先必须要兼顾心、脑、肺这几个重要脏器才能保证生命。
