肛瘘手术完成以后，病人住院天数需要根据自身伤口的复杂程度决定。最普通、基本的肛瘘，需要1-2周的住院时间；但是如果是肛瘘位置比较复杂，可能需要相应地延长住院时间，至于所延长时间应根据病人的具体情况，可以延长到3-4周，甚至需要分期手术则住院时间更长。一般伤口恢复的前期需要在医院里住院，尤其是在橡皮筋就是挂线掉线之前，此段时间内医生是要求住院，在医院里进行观察，到了中后期就可以出院，回到家里以后自己进行伤口的熏洗坐浴，涂抹药膏进行换药，在此期间需要隔几天到医院里由医生复查。如果是非常复杂的肛瘘，可能后期要进行二次手术，需要病人随时就诊。