唇腭裂主要是在怀孕第四周至第十周期间，由于某些致病因素导致胎儿面部发育障碍所致。而目前认为可能致病的元素有：

1、遗传原因，患儿直系或者是旁亲属中有类似情形发生，大约有20%左右的唇腭裂患者可能查出有遗传病史；

2、感染或者损伤，怀孕初期两个月左右母亲感染过病毒，比如流感、风疹或受过某些损伤，可能成为唇腭裂的致病因素；

3、母亲在怀孕期间患有贫血、糖尿病、严重的营养障碍等慢性疾病；

4、母亲怀孕期间服用过某些药物，如镇静剂、抗癫痫的药、激素类药物等；

5、怀孕期间母体接触过大剂量的X线照射。因此唇腭裂的预防关键在于怀孕早期。