肛瘘患者进行手术治疗以后，其创面的整个愈合过程，一般需要持续约4-6周的时间，4-6周的时间中，患者并不需要完全在医院度过。普通的肛瘘患者术后，首先要控制住炎症，即控制住局部感染，并且需要进行局部换药。临床上建议离医院比较近的患者，根据创面的情况，如果创面的局部感染得以控制，住院约1周即可出院。患者出院后可选择每日或间隔1-2日到医院换药，直至肛瘘完全愈合。高位复杂性肛瘘患者的手术创面比较大，牵扯到的组织比较多，因此对于术后换药的要求较高。如果患者离家近，也可以同普通肛瘘患者一样，无需注射抗生素或者静脉注射治疗，可以出院，然后间断性地到医院换药，直至创面痊愈。如果患者的家庭住址距离医院较远，临床会酌情建议患者延长住院时间。
