新生儿红斑狼疮治疗主要和患儿症状表现密切相关。如果新生儿红斑狼疮，主要是以皮损为主，一般不需要特殊治疗，此皮损有自愈倾向。患儿6-8个月时可以自行消退，不遗留有痕迹。

如果新生儿红斑狼疮以心脏受累为主，主要表现为房室传导阻滞，在胎儿期会出现，妈妈怀孕24周左右时可能会出现相关症状。如果在怀孕期间出现此症状，可以应用药物干预，出生以后可能不会出现明显心脏受损情况。如果孩子出生以后发现心脏受损，轻症患者可以密切观察病情，不用特殊治疗，Ⅲ度严重房室传导阻滞需要安装起搏器。部分新生儿患者可能会出现一过性肝脏或者血液系统受损，轻症患者只需要定期监测相关指标即可。指标明显异常变化的患儿，可以应用小剂量的激素治疗。