甲钴胺与腺苷钴胺的主要区别如下：

1、结构不同：甲钴胺主要是甲基钴胺素，而腺苷钴胺外是腺苷基团；

2、作用位点不同：甲钴胺主要作用于神经细胞的细胞质，腺苷钴胺的作用位点主要为线粒体辅酶；

3、功效不同：甲钴胺主要用于修复周围神经病变引起的受损神经，腺苷钴胺的主要功效是促进修复、生成红细胞，用于治疗巨幼红细胞贫血。

如果腺苷钴胺需要通过代谢产生甲钴胺而治疗周围神经病变，虽都属于维生素B₁₂活性物质，但结构功效和作用位点还是略有区别。