射精以后疼痛主要为生殖系统感染，尤其是精囊炎和前列腺炎，以及泌尿系统感染，如尿道感染，膀胱感染等。无论是生殖系统感染，还是泌尿系统感染，从治疗角度而言，都需要进行抗生素的核心药物治疗，比如磷霉素、喹诺酮或头孢类药物的选择。但也存在区别，具体如下：
1、生殖系统感染：除口服抗生素外，还建议患者应该在平时积极参加体育锻炼活动，避免久坐。同时在饮食上应该适当减少辛辣、刺激类的食物摄入，尽量避免酒精类食物、饮料摄入，通过综合调整，可以对生殖系统感染取得比较理想的控制和缓解效果。如果极个别患者生殖系统感染比较严重，还可以考虑以静脉输液的形式使用抗生素，或口服活血化瘀的中成药辅助治疗，巩固疗效；
2、泌尿系统感染：通常主张患者多喝水，每天保持在2000-3000ml的饮水量，配合治疗以后，通常效果比较好。
