脑部CT的检查危害主要是辐射，脑部CT所产生的辐射量大概为2mSv，但检查过程中都有防护，如在敏感部位和器官上用铅皮遮挡。目前CT机都较智能化，配有自动毫安装置，根据扫描部位不同，机器可自动调节扫描参数，最大程度的降低辐射剂量。

脑部CT检查是脑部疾病常用的检查方法，可发现颅内的许多病变，并且可明确诊断，如颅内肿瘤、颅内出血、脑梗塞、颅内血管性病变、头颅外伤及颅骨骨折等，都可通过CT明确诊断。