怀孕前三个月是胎儿发育的关键时期，大部分胚胎停育都发生在怀孕8-12周，因为一般早期流产主要是由胎儿染色体异常所致，属于自然淘汰，所以大部分流产就发生在孕早期。通常孕早期流产会出现阴道出血、腹痛等表现，且B超提示胎囊或胎儿的发育晚于正常或远远低于正常时，有可能会出现胚胎停孕。

胚胎停育实际上属于稽留流产，就是胚胎停止发育，但并没有从母体的宫腔内排出，所以在怀孕早期要做B超观察胎儿的健康状况、血HCG、孕酮及雌激素水平，避免发生很长时间的胚胎停育而没有任何表现，出现延误治疗的情况。大部分胚胎停育都是有原因，胚胎停育60%以上的原因是胎儿染色体异常，还有可能是怀孕早期病毒感染所致。