男性染色体检查主要是通过抽血化验完成，通过对男性血液样本中DNA以及核酸做出提取，然后进行显微镜下染色体形态、染色体变异程度，以及特殊位点检测。可以用来排查，男性是否具有不适合生育的先天性或遗传性疾病，对于频繁反复流产的夫妻，也需要做有针对性的染色体检查。
男性染色体检查在临床上是比较常规的生殖医学检查技术，主要目的是尽可能提高男女双方生育效率，以及避免生育以后，胎儿出现先天性或遗传性疾病的风险和可能，提高优生优育的质量，是目前在临床上做男性染色体检查最核心的目的。但并非所有的患者，都需要在结婚前或生育前，常规做染色体检查，除非有特殊病史，如家族遗传史，或有反复流产的情况，医生才会有针对性的检查。
