如果肝移植适应证选择得当，多数肝移植患者术后可获得长期生存。良性肝病、急性肝衰竭、肝硬化等导致的肝功能失代偿，患者进行肝移植后，5年生存率可达70%以上，10年生存率可达50%以上，即多半患者可以生存10年以上，属于长期存活。

如果移植前病情过于危重，部分患者可能已经出现多器官功能衰竭，或术后出现感染、严重的胆道或血管并发症，以及晚期肝癌患者进行肝脏移植后肿瘤较快出现复发转移等，都可能导致肝移植患者不能长期存活。手术也可能存在相关并发症，所以严格把握手术适应证，是提高肝移植总体生存的主要因素。一般晚期肝癌患者不建议进行肝脏移植，部分病情过于危重的患者，术后并发症发生率较高，同时死亡率也较高。