贲门失弛缓症在经过正规治疗后预后非常好，特别是现在内镜技术的开展，如经口内镜肌切开术，即POEM术的开展，病人治疗后吞咽困难、反流、胸痛、烧心、反酸症状可得到明显改善，包括呼吸道症状，咳嗽、咳痰都明显改善，从而提高生活质量，甚至可达到治愈效果。

贲门失弛缓症预后较好，关键是及时到医院就诊，采取最佳治疗方案，疾病恢复也会较好。如果不注意、不及时就诊或采取必要措施治疗，长时间后食管扩张较为严重，会出现积食和其它严重问题，从而造成治疗困难。