目前已知的HPV包括121种亚型，其中16、18、31、33、35、39、45、51、52、56、58、59、66和68型等，因为与肿瘤的发生关系密切而被认为是高危型，其持续感染是子宫颈癌及癌前病变发生的确切病因。因此进行HPV检查，可以区分罹患子宫颈病变的高风险人群，也就是高危型HPV感染者，所以HPV检查也是子宫颈癌筛查的重要手段之一。在临床上用于与细胞学的联合筛查；单独子宫颈癌初筛及细胞学 ASC-US病人的分流；子宫颈病变治疗后的复查，如果手术12个月后检测HPV呈阳性，则提示可能有残留病灶或者是复发的风险。需要特别强调的是HPV感染常见于性生活活跃的人群，但并非感染HPV就一定已患有或会患有宫颈癌，大部分感染者会在两年内自然消退，所以大家不必过于恐慌。
