宫颈纳囊绝大多数是子宫颈的生理性变化，子宫颈转化区内，鳞状上皮取代柱状上皮的过程中，新生的鳞状上皮覆盖子宫颈腺管口，将腺管开口阻塞，导致腺体分泌物流出受阻，潴留则形成囊肿。此外，子宫颈的局部损伤或慢性炎症亦可使腺管开口狭窄，导致子宫颈腺体囊肿形成。宫颈囊肿临床容易诊断，妇科检查可见子宫颈表面突出单个或多个青白色小囊泡，通常不会自行消失，有时可增大。宫颈囊肿通常无需处理，因为它是一个生理的状态，但需强调，定期的宫颈癌筛查非常重要。