口腔溃疡反复不愈的病因较复杂，与个人体质存在差异有关，常见的原因如下：
1、机体免疫性差异：包括细胞的差异，体液的差异以及自身免疫的差异；
2、家族遗传性差异：家族遗传性的特点，在直系亲属之间表现更明显；
3、系统性差异：主要表现在消化系统，以及内分泌系统、精神因素等方面；
4、感染因素：以消化道十二指肠部位的幽门螺旋杆菌接触为主；
5、环境因素：包括不良生活习惯、精神压力等。