根管壁侧穿是牙髓治疗失败的重要原因，常常是由于不正确的开髓、扩根方法所导致，桩核制作时的盲目操作也会造成侧穿。如果穿孔能够早发现、早治疗对预后影响较大。一般新鲜的穿孔直径＜1mm，相对预后良好，陈旧性直径＞3mm的穿孔，则预后不确定，需要定期观察随诊，因此临床上正确判断穿孔的发生十分必要。

穿孔出现的主要表现为拔净牙髓以后根管内出血明显，吸潮纸尖中部有血迹，尖端干净。X线诊断丝从根管壁穿出，根管长度测量仪在根管侧未到根管工作长度时显示超出根尖孔，显微镜下可以看到明显的穿孔部位和牙周软组织的粉红颜色，或者是陈旧的坏死样软组织。

根尖部穿孔往往是由于器械尖端没有顺应根管的弯曲形态，或者是工作长度确定不准确，器械过度预备所致的根尖部根管壁穿孔，在穿孔前往往先出现根尖偏移，包括台阶的形成、根尖拉开等根中部侧穿。根尖区穿孔在做了完善的根管治疗以后，配合根尖手术及根尖切除，加上根尖倒充填。

根中部的穿孔可以在显微镜下从根管内修补，或者是根充后外科手术修补，MTA是修补的良好材料。根管颈部穿孔多发生在寻找和扩大根管口及GG钻应用不当时，特点是预备过程中突然出血，肉眼或者是镜下可以直视穿孔存在。X线诊断丝照相和根管长度测量仪可以帮助确诊。颈部穿孔可以通过髓腔内修补或者是手术翻瓣修补。