口腔黏膜溃疡主要是因为内分泌因素、病人自身心情情况以及免疫因素这三个方面对口腔黏膜溃疡的影响比较大。因此，病人就诊时首先要从这三个方面与病人沟通，解决病人的心理压力问题，保证良好睡眠，做好心理疏导。其次，严重的口腔黏膜溃疡需要配合药物治疗，其中包括全身用药以及局部用药，全身用药包括激素类泼尼松、免疫调节类胸腺肽转移因子以及沙利度胺。特别严重影响到病人生活、说话、进食的情况下，可以通过局部用药来缓解病人疼痛，局部用药主要起到促进创面愈合、缓解疼痛的作用。其中，临床上比较常用的，首先是漱口液复方氯己定，主要消除细菌预防感染；其次是促进创面愈合，曲安奈德口腔软膏以及重组牛碱性成纤维细胞生长因子这类药物。
