打了HPV疫苗以后内裤咖啡色不是正常的表现，通常内裤呈咖啡色说明有阴道出血，而注射了HPV疫苗以后，一般是不会导致阴道出血。导致阴道出血的原因很多，而注射HPV疫苗以后，没有这种机制会导致阴道出血。HPV疫苗是通过注射减毒HPV病毒以后，使机体产生免疫力，免疫力的产生在注射后数日才开始显现。而出现阴道出血可能是其他原因导致的，导致阴道出血常常与HPV疫苗没有关系。
什么原因会出现阴道出血？可能由于下丘脑-垂体-卵巢轴功能异常，也可能由于子宫的器质性病变，如子宫肌瘤、子宫腺肌症、子宫内膜息肉、子宫内膜病变等，也有人因为过度紧张，精神紧张可以使得月经发生紊乱，出现阴道出血。总之内裤呈咖啡色并不是正常的表现，是异常子宫出血的表现，应该寻找原因，不应简单地认为是注射HPV疫苗以后造成的。
