心肌炎治愈的时间与心肌炎严重程度相关，如轻型心肌炎可能14-30天可以得到治愈，如重症心肌炎或暴发性心肌炎，可能治愈时间较久，有可能数月，甚至1-2年可能被治愈，甚至可能从急性心肌炎转变为迁延性心肌炎，甚至可能转变为慢性心肌炎。

心肌炎的病程还有预后情况，主要根据心肌炎的病变严重程度进行恢复。大部分心肌炎经过积极识别并及早给予正确治疗，大部分心肌炎患者预后较良好，比如暴发性心肌炎，因为起病急且进展比较迅速，早期容易出现电衰竭或泵衰竭，是儿童心血管内科的急危重症。同时如果一旦没有早期的识别，会随时出现恶性心律失常或心源性休克，随时有生命危险，会导致心源性猝死。但如果经过早期识别，尤其是现在体外膜肺氧合(ECMO)早期在心肌炎的应用，大部分危重心肌炎经过综合治疗可以得到较好的恢复，甚至不遗留严重的心脏并发症。