肛瘘手术的相关并发症有以下情况：
1、最常见肛门功能会受到严重影响，只要做肛瘘手术，大多数患者肛门功能或多或少有影响；但多数患者影响比较轻微，对控便功能影响不是很明显，不会造成失禁；
2、肛瘘做完手术以后肛门狭窄，但几率较低；因为肛瘘手术会把肛门肌肉切开一部分，所以患者做完手术后一般不会引起严重狭窄情况；
3、肛门形态会出现变化，尤其是较深的复杂肛瘘，甚至要把肛门打开，患者会发现肛门有形态变化，出现钥匙孔样畸形，即肛后面有小窟窿样东西，也相对比较常见；
4、部分患者会出现肛门总是黏糊，即肛门溢液的情况；肛门切完以后也要长瘢痕，瘢痕组织弹性相对于皮肤相对下降，形成肛门小槽，肛门黏液会通过肛管内槽流到肛门外面，此情况相对比较常见。
综上所述，肛瘘手术以后并发症最常见肛门功能影响、肛门狭窄、肛门溢液及肛门形态变化四个状态。
