三个月宝宝房间隔缺损9mm，具体处理措施需根据宝宝有无症状出现决定。房间隔缺损的症状出现较晚，即使房缺较大也不会出现症状，因为房缺分流到肺内部的血相对较少，也较晚，并不像室间隔缺损分流量大，且早期便出现症状。如果孩子有症状出现，应及早干预。另外，症状出现较迟，不用处理，可以等到症状出现后，即6个月以上可以做房间隔缺损手术。

如果房间隔缺损9mm，通常手术修补为主，因为较大的缺损做微创、做介入都较难做，而手术修补相对较安全。在6个月以上做较好，但如果早期3个月时房间隔缺损9mm，出现反复肺炎史或者生过一次肺炎，且有手术指征，也应早期行手术治疗。即3-4个月患儿也可以进行房间隔缺损修补手术。