牙周炎的治疗采用多方面多方法，且需要较长时间才能完成一系列治疗，治疗过程分为四个阶段：
1、基础治疗阶段，包括教育并指导患者自我菌斑控制，建立正确的刷牙方法和习惯，使用牙线、牙缝刷等工具保持口腔卫生，进行洗牙和龈下刮治术以消除牙面及牙根菌斑、牙石，消除其它局部刺激因素及菌斑滞留因素，比如充填龋洞、改正不良修复体等，拔除无保留价值或预后较差的患牙，炎症控制后要进行咬合调整建立正确的咬合关系，必要时可以配合药物治疗，纠正吸烟、糖尿病等全身或环境因素；
2、牙周手术治疗阶段，基础治疗后再评估，仍有5mm以上牙周袋并且探诊出血的牙齿或牙龈及骨形态不良的牙齿，需要进行手术治疗，直视下彻底清除感染纠正牙龈及骨外形或获得牙周组织再生；
3、修复治疗阶段，通过修复正畸的手段修复缺失牙齿、固定松动牙齿以及建立稳定的咬合；
4、牙周支持治疗阶段，根据患者具体病情确定复查间隔期，每次复查检查患者的口腔卫生情况、牙龈炎症情况、危险因素控制情况等，根据发现的问题制定下一步的治疗计划，并给予指导和治疗。