肠道疾病引起的消化不良，其主要症状是腹胀、嗳气、排气增多，还会出现大便变稀、大便不成形、腹泻，另外患者的大便中可以出现未消化的食物。肠道消化不良可以由于肠道器质性病变或功能性病变引起，一般器质性病变包括肠道炎症性疾病，比如溃疡性结肠炎、克罗恩病等。
另外很多人是肠道功能性的消化不良，比如胃肠道动力过快或胃肠道菌群失调，此时会引起胃肠道内产气增多、消化功能减退，容易出现嗳气、打嗝、排气增多，以及明显的腹胀、大便不成形的情况。这种情况下，可以应用消化酶，比如胰酶，包括胰淀粉酶、脂肪酶和蛋白酶帮助消化。还可以应用益生菌，调节患者肠道内的菌群失调。同时应用调节胃肠道动力的药物，如曲美布汀，对于肠道引起的消化不良也有较好的效果。
