核磁共振检查范围非常广泛，可以对全身大部分器官进行检查，尤其核磁共振特点，对中枢神经系统、颅脑、脊髓、骨骼系统，以及软组织显像率特别清晰，特别对疾病轮廓边缘可清除观察，故医生特别喜欢用核磁共振检查器官组织病变。核磁共振临床上使用根据疾病划分，主要应用于以下几个疾病：

1、肿瘤方面：如可应用于检查脑肿瘤、椎管肿瘤、肝脏肿瘤、胰腺肿瘤、肾脏肿瘤、骨肿瘤、宫颈癌、卵巢癌、乳腺癌、前列腺癌等；

2、血管性病变：磁共振检查主要运用于急性脑梗塞诊断、脑血管畸形诊断、脑出血、肝脏血管瘤等病变检查。另外也可做脑静脉成像、脑动脉成像；

3、心脏磁共振成像，可以观察心脏、血管病变；

4、磁共振在外伤性病变中应用广泛，比如椎体压缩性骨折、关节骨折，关节脱位以及半月板损伤、韧带损伤、椎间盘突出方面，也应用广泛。