支气管扩张为结构改变，在扩张局部纤毛细胞会被破坏。痰液很难被咳出，会造成局部的反复感染，病人会不断用抗生素。抗生素刚开始用时较敏感，但越用越耐药，故治疗效果逐渐变差。

另外长期用抗生素，可能会出现真菌感染。本病易迁延不愈，抵抗力下降，有时会引起结核感染，所以支气管扩张因恶性循环反复感染，最后造成肺功能减退，造成肺心病、肺动脉高压、肺气肿，严重者可导致呼吸衰竭。

支气管扩张反复的感染可以引起咳血，甚至大咯血，所以支气管扩张一定要在早期积极控制反复感染。