指甲中间凹陷的原因较多，具体如下：

1、和外部刺激或外伤有关，外伤可能会导致指甲下甲床形成瘢痕，或指骨有凹陷性骨折，这些都会导致指甲的凹陷；

2、部分患者喜欢抠指甲，产生慢性炎症反应，指甲无法按正常形态生长，也可能出现凹陷；

3、和整个人身体状态有关，部分患者可能由于缺钙，或呼吸系统和循环系统等问题，导致指甲畸形；

4、部分患者因局部真菌感染导致指甲畸形。

指甲中间凹陷需到医院皮肤科或请整形科医生明确病因，而后有针对性地采取治疗措施和手段。