肛瘘手术的成功率从两个方面考虑，具体如下：
1、肛瘘复杂不复杂，如果是低位单纯性肛瘘，或者皮下瘘，那么成功率是非常高的，这个毋庸置疑；如果是高位肛瘘，又是高位复杂性的肛瘘或者高位马蹄形肛瘘，或者全马蹄肛瘘，成功率就会下降；
2、治疗大夫的水平、经验，因为对于肛瘘的治疗没有规定，每个大夫有自己的观念、方法、经验，所以根据大夫的水平高低，对于肛瘘治愈的成功率也是非常关键、至关重要的。比如有很多不能够把每个管道都给清理干净，肛瘘肯定会复发，所以要求大夫能够治疗高位复杂肛瘘的技术。一定要有很好的经验，很好的判断能力，很好的检查能力，将所有的瘘管都能检查出来，然后才能彻底的治疗好，而且一般使用虚实挂线的方法，是现在损伤最小、成功率最高的治疗方法。