甲硝唑用于治疗厌氧菌感染、阿米巴虫和滴虫感染等，属于第一代抗炎氧菌药，为硝基咪唑类抗菌药物，口服吸收效果较好。因此可预防或治疗厌氧菌引起的感染，如腹腔感染、消化道感染以及女性生殖道感染，如阴道毛滴虫病、下呼吸道感染、皮肤软组织感染。厌氧菌感染包括口腔厌氧菌感染，如牙疼可服用甲硝唑抗感染治疗。对于败血症、心内膜炎、脑膜炎等感染症状及抗生素引起结肠炎，均具有较好治疗效果。
甲硝唑属于抗菌药物，应于医生指导下合理使用，必须存在相应感染指征才可使用。该药物用药过程中应避免饮酒，也要避免饮用含酒精饮料，甲硝唑具有双硫仑样作用，若用药时饮酒可能发生严重不良反应，导致体内乙醛蓄积，可能出现面部潮红、呼吸困难、恶心、头痛、头晕等症状，严重者可能出现过敏性休克，因此用药期间应避免饮酒。
