眼睛长小水泡的原因如下：

1、淋巴管堵塞：人体有两种循环，即血液循环和淋巴循环，用手揉眼睛可能会导致淋巴循环阻塞，在眼白的位置出现大小不等，单个发展或成簇发展的透明的小泡。一般来讲不会出血，是透明的液体，边界非常清楚，部分患者可能没有任何症状，则无需任何治疗。若引起眼部摩擦，则应该到医院挑破，将其内部的液体排出，并点用激素类眼药水，大部分患者就不会再复发；

2、泡性结膜炎：就是在眼白的位置隆起小水泡，但是小水泡周围有血管充血，患者还可能会有痒、磨等异物感症状。泡性结膜炎是一种免疫系统疾病，在临床上也会使用激素类眼药水，比如氟米龙、典必殊，使用1-2周症状就会完全缓解；

3、患者用手揉眼睛，手上可能有过敏原，引起眼睛的球结膜水肿，也可看到白眼球隆起。如果身边没有合适的眼药水，患者一定不能用手揉眼睛，需冷敷，只要脱离过敏原的存在，几个小时以后就会完全缓解。