血清谷氨酰转肽酶升高的常见原因是指胆管细胞受损。胆管细胞分为肝内胆管和肝外胆管，所以临床上根据谷氨酰转肽酶升高的倍数以及碱性磷酸酶升高的倍数，可以进行诊断。谷氨酰转肽酶＞正常的3倍以上，碱性磷酸酶＞正常的1.5倍以上，临床诊断胆淤积。
胆淤积可分为2种情况，根据解剖位置分为肝内、肝外，在肝内的因素中，最常见的疾病包括肝细胞受损后引起的胆淤积。还有自身免疫性肝病，比如胆管受损或原发性硬化性胆管炎、原发性胆汁性胆管炎等，会出现转肽酶升高。
如果肝外胆道所有的肝总管和胆总管移行到十二指肠，解剖位置中出现某种物理性压迫，导致胆汁流通不畅，也会引起转肽酶升高。如果转肽酶明显升高，高于10倍以上，要警惕有没有恶性肿瘤发生，最常见的是胆管细胞癌。
