儿童矮小症的病因，可分为以下几大类：

一、生理性原因：

包括家族性矮小和体质性青春期延迟，其生长速度基本正常，骨龄与身高、年龄相符。

二、病理性原因：

1、内分泌性因素：如生长激素缺乏症、甲状腺功能减退症最为常见。

2、全身性疾病：包括慢性消耗性疾病，如慢性肾病、先心病等，长期营养不良或吸收障碍。

3、骨骼遗传性疾病：如软骨发育不全。

4、染色体异常：如特纳综合征。

三、社会心理因素：

严重情感剥夺也可导致心理社会性矮小。