急性发作的结膜炎通常会合并眼表的分泌物，结膜炎的基本特征包括充血以及分泌物。病毒性结膜炎的分泌物具有自身特征，为水样的分泌物，即质地较稀、像泪水一样，此类病人从外观上看总是泪汪汪的样子，但并非泪道的问题，主要还是因为有水样的分泌物，也是区别于其他类型结膜炎的特征。

细菌性结膜炎的分泌物，通常相对比较黏稠、成型，可以呈团状，可表现为黄色、白色，甚至黄绿色。如果有病毒性结膜炎，同时又合并细菌感染，可表现出既有水样分泌物，也有成型的分泌物。对于过敏性的结膜炎，可表现为眼部有透明、黏稠、拉丝状的分泌物。

对于分泌物可进行病原学的检测以及细胞学的检测，如结膜的刮片，在显微镜下染色，明确细胞构成，来分辨为过敏性还是其他病原感染性，以及是病毒还是细菌的可能性大，以提供病原学的证据。

也可以采用其他方法检测病原的来源，但需具有更好的检测条件，此外还存在假阴性、假阳性的问题。对于病毒性结膜炎的治疗，需针对病毒，进行抗病毒治疗。