鼻咽癌晚期以放化疗为主。对于不能承受放疗，比如严重颅内转移的患者，放疗剂量达到极限，不能再增加放疗剂量，这时以药物化学治疗、基因治疗、免疫治疗为主，必要时辅助中医中药治疗。

对于局部转移到颈部淋巴结的患者，手术切除颅底组织导致破坏，产生溃烂、腐烂坏死造成较多症状，可由耳鼻喉科医生在内镜下对坏死组织进行清理，以提高患者生存质量，减缓肿瘤发展进程。