PET-CT检查相对用时较长，从注射检查药物以后到检查结束可能需要60-90分钟，因为PET-CT是当前较高端检查设备，需要精心准备，过程相对较为复杂。
PET-CT检查首先需要临床医生判断患者检查必要性，如果需要检查，临床医生会给患者开检查预约单，患者拿到预约单以后需要到核医学科进行登记，采集病史，包括既往检查资料、影像资料等。
登记以后需要给患者准备检查需要的放射性药物。另外，患者需要配合检查，例如在第二天检查，前一晚在晚餐以后尽量避免进食，并且晚餐尽量避免食用糖分较高食物，至少需要禁食4小时以上。检查当天患者来院以后需要采集患者体重，根据体重计算患者用药量，并以最小用药量达到最好的图像采集效果。同时采集患者血糖，患者血糖对患者图像采集较为重要。前期准备结束以后给患者注射相应核素显像剂，注射显像剂以后患者需要在专门休息室安静休息，等待药物在全身分布，之后可以到PET-CT机进行采集图像，采集图像过程中需要10-20分钟，之后则由专家阅片对疾病做出诊断。
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