发烧患者会结合患者的临床表现、流行病学史以及精神状态，总体判断病情。如果是急性感染，要到发热门诊就诊，通过急性传染病筛查，排除急性呼吸道的传染病，再进行病原学方面的检查，比如针对病毒、细菌、支原体、衣原体等常见病原微生物感染，做初步的筛查。
可以做血常规、C反应蛋白、支原体、衣原体的抗体检测，通过初步检查，如果能够分辨出是哪类病原微生物感染，可以经验性的选择用药。多数情况下通过急性抗感染治疗或者对症处理，病情大多能够得到及时控制。如果患者发烧时间较长，还要进一步根据患者的流行病学史、体格检查，还有初步实验室结果，进行抽血化验，比如血沉化验、免疫球蛋白、自身抗体以及铁蛋白等实验室检查。还可以通过B超、CT、核磁等影像学检查，必要的时候还需要组织活检，比如肝活检或者淋巴结活检，进一步明确病因。
