小孩胃痛最常见的原因为胃病，如胃炎与溃疡，尤其胃炎比较常见。但是有时胃镜进去以后，并没有发现明显的炎症表现，即黏膜水肿、充血、糜烂，有时糜烂不明显。如果是肠胃道功能有异常，称为功能性胃肠病，即结构并无明显异常，但是患者会感觉疼痛，这与胃肠功能有关。胃部疼痛最为常见的原因为功能性胃肠病。
有时胃痛可能是一些少见的原因或者严重的原因，如小儿胃痉挛导致疼痛，突然发生胃痉挛，往往原因不明。但很多胃痉挛的发生为继发性，即患者原来有炎症、溃疡存在，继发胃痉挛。其它部位的疼痛也可能被误认为胃痛，尤其是胆道炎、胆囊炎或者胆石症的疼痛。
