水丸和蜜丸的区别主要有以下几点：

1、颗粒不同：水丸颗粒较小，蜜丸颗粒通常较大；

2、赋形剂不同：水丸是将药物打成细粉后以水作为辅料，或者根据药物作用特点不同采用黄酒、醋等作为辅料，加工而成的一种丸剂，容易崩解，有利于药物吸收，水丸不容易吸潮，长期储存的难度较低。蜜丸主要以蜂蜜作为赋形剂，蜂蜜本身具有滋阴、润燥功效，属于具有滋补作用的药物，药物加工成蜜丸后性味会比较甘润，增加药物的补益效果，通常蜜丸用来制作具有滋补作用、补益作用的药物，不易储存。