头上长毛囊炎主要是头壁毛囊细菌感染导致，如果只有少数偶然发生，只需要局部外用药物，比如使用抗菌、消炎的夫西地酸乳膏、莫匹罗星软膏、多粘菌素B软膏或者使用碘酊外擦，通常能在较短时间内控制、消退。
如果头上反复出现毛囊炎，要内服系统的抗菌素进行治疗，比如口服头孢类、青霉素类、大环内酯类、喹诺酮类抗菌素等，才能达到较好效果。另外一方面，要寻找病因，毛囊炎反复发生可能与患者存在基础疾病有关，比如患有糖尿病、慢性肝肾疾病、长期吃免疫抑制剂以及糖皮质激素等，导致机体免疫功能下降，容易引起毛囊内细菌过度繁殖，导致毛囊炎。要去除相关病因，毛囊炎才能得到较好控制。头上长毛囊炎可能与个人习惯有关，比如洗头不勤或者洗头过于强烈，导致头皮损伤，均可以引起毛囊炎，也要适当加以注意。
