直接咽樱桃核一般不会对人体有影响，之所以认为樱桃核有毒，是因为樱桃核中含有氰苷成分，人体可以代谢成为氢氰酸而发生中毒。但是一颗樱桃核只含有几十微克氰苷，转化成氢氰酸的量更少。而一个成年人如果发生樱桃核中毒，需要至少摄入2mg/kg的氢氰酸，换算后即一个成年人要吃1000-2000枚樱桃核，才有可能导致中毒。而正常情况下不可能吃几千枚樱桃核，因此偶尔吞下几枚樱桃核一般不会导致中毒。
但需要注意的是樱桃核在体内会影响消化，如果误吞樱桃核，可以服用增加胃肠动力的药如吗丁啉、加斯清等。此外，也可以多吃粗纤维食物如芹菜、韭菜等，以增强胃肠动力，将樱桃核尽快排出人体。在日常生活中樱桃核导致的危险主要是樱桃核误吸入气道，而经消化道导致中毒的情况微乎其微。因此在给孩子尤其是婴幼儿喂食樱桃时，不要在孩子大哭、大笑或烦躁时喂食，以免使樱桃核误食入气道，引起窒息而发生危险。
