口腔病理由外科医生切取一块组织，送至病理科，病理科通过组织取材，即把组织切成小块，经过组织脱水处理后进行组织包埋。

组织包埋是将组织通过石蜡固定，变成一个硬的组织，便于进行组织切片。组织切片是将其切成4μm左右的薄片，组织切片后进行组织染色。

通常所用染色方式是苏木素-伊红染色，即区域染色，把细胞胞核染成蓝色，细胞包浆染成红色，此时可在镜下分辨不同的组织细胞和形态，根据此情况可做不同的切片诊断。

切片可在显微镜观察下进行诊断，显微镜目镜通常有4倍、10倍、20倍和40倍等类型。