正常人体尿液呈清亮、淡黄色，但尿液发黄且在水中有晶体析出时可以分以下两个方面考虑：

1、尿液发生碱化，导致尿液中原本无法肉眼看见的无机盐类晶体析出，沉淀下来，此过程可能与饮食因素有关。通常患者可以通过吃酸性食物改变尿液碱化以及尿液浑浊现象；

2、病理性尿液发黄、浑浊，比如患者在发生泌尿道感染或者有尿结石时，小便可能会变黄、变浑浊。如果患者尿液中有晶体出现，将小便放置一段时间，在尿液底部可以看到结晶析出、沉淀。此时建议患者及时到医院就诊，排除相关疾病，进行对症性治疗。