肛瘘痔疮手术后是否会复发因人而异，具体如下：

1、肛瘘：多是因为肛管内的腺体感染形成脓肿，再变成瘘管，理论上来讲，肛门部的腺体和腺管有23条左右，手术后即使切除了原来的肛瘘，还是有肛瘘再发的可能性。肛瘘手术的关键点是把肛瘘的瘘道、感染灶及内口充分处理好，一旦有瘘管的残留，也容易引起复发。一般来说，单纯性肛瘘复发几率较低，复杂性肛瘘的复发几率高达30%以上；

2、痔疮：是由于肛垫引起的病变，痔疮的治疗无论是药物、手术，还是其他方法，都是以减轻症状为目的，不能切除所有的肛垫。如果切除了所有的肛垫，痔疮不复发，但是肛门的精细功能也会减退，甚至消失。所以痔疮手术后一定会复发，其复发的时间取决于患者的生活习惯，生活习惯越好，复发的可能性越低。