面肌痉挛以手术治疗为主，少数患者会选择面部局部肌肉注射肉毒素治疗，但此类治疗作用短暂，且会造成面部神经肌肉接头麻痹，3个月以后麻痹效果减退，症状会复发，因此肉毒素注射的方法治标不治本。

治本的方法为微创手术，在患者耳后方后颅处做4cm左右的切口，进行微创开颅到达脑干附近，将神经周围异常压迫的动脉血管或静脉血管进行分离，用一种柔软的特氟龙特殊材料隔绝，阻断异常的神经冲动通过动脉或静脉传导到神经鞘膜，即可使疾病得到治愈，手术恢复也较快。