针灸百会穴的作用，一般有以下三点，包括治疗头痛、神志相关疾病、高血压等。具体如下：
1、头痛：百会穴位于在人体颠顶部，针灸百会穴，常可治疗头痛；
2、神志相关疾病：由于位于头部，可治疗神志相关的疾病，如癫狂痫症；
3、高血压：针刺该部位可降血压，但如果艾灸百会穴，有升血压的作用，治疗时应予以注意，不要将作用混淆；
4、其它：百会穴还可提升阳气，可治疗中气下陷的疾病，如胃下垂、宫脱垂、脱肛等，都可通过艾灸百会穴来进行治疗。
但针刺百会穴有一定禁忌，包括小孩、阳亢患者等。具体如下：
1、小孩：对于小孩应谨慎使用，尤其是2-3岁前，囟门没有完全闭合，骨缝没有完全长好，这时禁止针灸此处，此外艾灸也需谨慎；
2、阳亢患者：百会穴能提升阳气，故阳亢患者最好不要艾灸此处，否则患者阳气更亢奋、气血上涌，可能会引起血压升高，出现头痛、头晕等。
